在微生物清洗室中設置清潔空調系統，是為了創造溫度、濕度適當、空氣清新、無菌清潔的微環境，有利于實驗操作。傳統的空調系統只能在一定程度上控制溫度，清潔度無法完全控制，從而導致細菌滋生和繁殖。這種空調系統遠遠不能滿足微生物實驗室特定清潔環境的衛生要求。

潔凈空調系統經一系列技術措施設計后，控制實驗室內溫度、灰塵、細菌、有害氣體的濃度和氣流分布，保證室內人員所需的新風量和室內合理氣流流動，保持整個微生物實驗室的適當梯度壓力和定向流動，“無菌環境保障結構設計的另一個突出特點是大多數室內空調設備都保持在室外，這減少了非實驗室人員進入實驗室的機會，減少了污染，提高了實驗室的利用率。

1、凈化空調系統劃分

每個潔凈實驗室都是獨立的空調系統，緩沖室和潔凈實驗室是獨立的空調，以防止內部交叉感染和危險氣體泄漏。

2、空氣處理凈化過程

室內回風來自中效過濾器的回風端口(回風端口采用國家專利的固定風向可調風量回風端口，濾料在實驗室內易于拆卸和更換)。通過回氣管返回凈化組合式空氣處理器的回氣段，冷卻或加熱，然后通過機組中的初級和中級效果過濾器(過濾器置于機組正壓段)，從供氣管送出到裝有高效過濾器的供氣端。室外新風考慮處理進入凈化機組式空調機組的新風混合段，與室內的回風混合。經過衛生凈化組合空氣處理器的溫濕度處理后，空氣被均勻地送到潔凈區。

3、送風方式及氣流組織形式

實驗室末端送風采用專用484送風靜壓箱。送風靜壓箱內充滿了進口高效率低電阻無隔板高效率過濾器，底部設置有送風擴散板(擴散板和實驗室頂棚平坦且無縫)。 局部百級實驗室設置層流罩，采用垂直層流氣流組織形式，外形尺寸為1240×35，內部充滿了高效的過濾器，底部設置了均勻的擴散孔板。 潔凈的室內回氣是四角的底部回氣，保證了室內氣流的充分流動，帶來了良好的稀釋效果。 緩沖室在有效的送風口采用上下的回氣流氣流組織形式。